adaptyv

Cloud laboratory platform for automated protein testing and validation. Use when designing proteins and needing experimental validation including binding assays, expression testing, thermostability measurements, enzyme activity assays, or protein sequence optimization. Also use for submitting experiments via API, tracking experiment status, downloading results, optimizing protein sequences for better expression using computational tools (NetSolP, SoluProt, SolubleMPNN, ESM), or managing protein design workflows with wet-lab validation.

1. Skontaktuj się z support@adaptyvbio.com, aby uzyskać dostęp do API (platforma jest w fazie alfa/beta). Otrzymasz token dostępu, który należy zapisać.

2. Ustaw zmienną środowiskową ADAPTYV_API_KEY z otrzymanym tokenem. Możesz to zrobić w terminalu poleceniem export ADAPTYV_API_KEY="twój_token_tutaj" lub utworzyć plik .env z linią ADAPTYV_API_KEY=twój_token_tutaj.

3. Zainstaluj wymagane pakiety Python: requests i python-dotenv. Użyj polecenia uv pip install requests python-dotenv.

4. Przygotuj sekwencje białkowe w formacie FASTA (nagłówek rozpoczynający się od > i sekwencja aminokwasów). Określ typ eksperymentu, jaki chcesz przeprowadzić, na przykład binding, expression, thermostability lub enzyme_activity.

5. Wyślij eksperyment przez API, podając sekwencje, typ eksperymentu i opcjonalnie adres webhook do powiadomień. Otrzymasz identyfikator eksperymentu, który pozwoli śledzić status i pobierać wyniki po około 21 dniach.

6. Śledź postęp eksperymentu za pomocą identyfikatora i pobierz wyniki, gdy będą gotowe. Możesz również optymalizować sekwencje białkowe za pomocą dostępnych narzędzi obliczeniowych przed wysłaniem do walidacji laboratoryjnej.