tooluniverse-sdk

Build AI scientist systems using ToolUniverse Python SDK for scientific research. Use when users need to access 1000++ scientific tools through Python code, create scientific workflows, perform drug discovery, protein analysis, genomics analysis, literature research, or any computational biology task. Triggers include requests to use scientific tools programmatically, build research pipelines, analyze biological data, search literature, predict drug properties, or create AI-powered scientific workflows.

1. Zainstaluj pakiet poleceniem pip install tooluniverse. Jeśli potrzebujesz wyszukiwania przez embeddingi, użyj pip install tooluniverse[embedding], lub pip install tooluniverse[all] dla pełnego zestawu funkcji.

2. Ustaw zmienne środowiskowe: export OPENAI_API_KEY="sk-..." (wymagane do wyszukiwania narzędzi) i opcjonalnie export NCBI_API_KEY="..." dla dostępu do baz NCBI.

3. Zaimportuj bibliotekę i zainicjuj ToolUniverse: from tooluniverse import ToolUniverse oraz tu = ToolUniverse(). Następnie załaduj narzędzia poleceniem tu.load_tools() — ten krok jest obowiązkowy przed każdym użyciem.

4. Wyszukaj odpowiednie narzędzia dla swojego zadania, na przykład: tu.run({"name": "Tool_Finder_Keyword", "arguments": {"description": "protein structure", "limit": 10}}).

5. Wykonaj narzędzie, wybierając jedną z dwóch metod: API słownikową tu.run({"name": "UniProt_get_entry_by_accession", "arguments": {"accession": "P05067"}}) lub funkcyjną tu.tools.UniProt_get_entry_by_accession(accession="P05067"). Druga metoda jest wygodniejsza w pracy interaktywnej.

6. Do przetwarzania wielu narzędzi jednocześnie użyj tu.run_batch() z listą wywołań — każde zawierające nazwę narzędzia i argumenty — aby uzyskać wyniki dla całej partii.