tooluniverse-precision-oncology

Provide actionable treatment recommendations for cancer patients based on molecular profile. Interprets tumor mutations, identifies FDA-approved therapies, finds resistance mechanisms, matches clinical trials. Use when oncologist asks about treatment options for specific mutations (EGFR, KRAS, BRAF, etc.), therapy resistance, or clinical trial eligibility.

1. Przygotuj dane pacjenta: określ typ nowotworu oraz profil molekularny, w tym mutacje (np. EGFR, KRAS, BRAF), fuzje genów lub amplifikacje. Jeśli pacjent wcześniej otrzymywał leczenie, zanotuj nazwy stosowanych leków i przyczyny niepowodzenia terapii.

2. Sformułuj pytanie dla narzędzia w języku angielskim lub polskim — system automatycznie przetłumaczy terminy medyczne na angielski w zapytaniach do baz danych. Przykłady: "Pacjent z rakiem płuca z mutacją EGFR — jakie opcje leczenia?", "Jakie są możliwości dla KRAS G12C?", "Pacjent nie odpowiada na [nazwa leku] — co dalej?".

3. Narzędzie weryfikuje dostępne narzędzia i bazy danych (CIViC, ClinVar, OpenTargets, badania kliniczne), a następnie rozwiązuje identyfikatory genów (Ensembl, UniProt, ChEMBL) dla mutacji wskazanych przez użytkownika.

4. Czeka na interpretację wariantów genetycznych z wielu źródeł: CIViC dostarcza informacji o wariantach i lekach, ClinVar zawiera dane o patogenności, OpenTargets pokazuje cele terapeutyczne, a bazy COSMIC i GDC/TCGA dostarczają kontekstu epidemiologicznego.

5. Otrzymujesz raport z rekomendacjami leczenia posortowanymi według poziomu dowodów naukowych. Każda rekomendacja zawiera konkretne opcje terapeutyczne, informacje o mechanizmach oporności oraz dopasowane badania kliniczne, jeśli są dostępne.

6. Wykorzystaj raport w dyskusji z pacjentem i zespołem onkologicznym — narzędzie dostarcza odpowiedzi na pytanie "co powinniśmy zrobić?" zamiast ogólnych danych, co ułatwia podejmowanie decyzji klinicznych.