tooluniverse-literature-deep-research

Conduct comprehensive literature research with target disambiguation, evidence grading, and structured theme extraction. Creates a detailed report with mandatory completeness checklist, biological model synthesis, and testable hypotheses. For biological targets, resolves official IDs (Ensembl/UniProt), synonyms, naming collisions, and gathers expression/pathway context before literature search. Default deliverable is a report file; for single factoid questions, uses a fast verification mode and may include an inline answer. Use when users need thorough literature reviews, target profiles, or to verify specific claims from the literature.

1. Zainstaluj umiejętność w swoim środowisku Claude/Copilot, wskazując repozytorium GitHub mims-harvard/ToolUniverse i ścieżkę skills/tooluniverse-literature-deep-research.

2. Sformułuj pytanie badawcze — określ, czy szukasz pełnego raportu (przegląd literatury, profil tematu, weryfikacja twierdzeń) czy odpowiedzi na pojedyncze pytanie faktyczne. Dla pytań prostych umiejętność automatycznie przejdzie w tryb szybkiej weryfikacji.

3. Podaj temat badań — może to być cel biologiczny (gen, białko), lek, choroba, lub ogólny temat akademicki. Umiejętność automatycznie rozpozna domenę i zbierze kontekst.

4. Umiejętność rozwiąże niejednoznaczności: zidentyfikuje oficjalne identyfikatory (Ensembl, UniProt dla celów biologicznych), synonimy, potencjalne kolizje nazw i zgromadzi informacje o ekspresji oraz szlakach metabolicznych.

5. Czekaj na wygenerowany raport zawierający listę kontrolną kompletności, ocenę wiarygodności każdego źródła (od T1 — mechanistyczne, do T4 — wzmianka), wyekstrahowane tematy oraz testowalne hipotezy. Wszystkie twierdzenia będą opatrzone przypisami do baz danych i narzędzi.

6. Dla pytań wymagających szybkiej odpowiedzi przejrzyj wersję w trybie faktoidów — otrzymasz bezpośrednią odpowiedź bez pełnego raportu.