Toolverse
All skills
Backend

string-database

by davila7

Query STRING API for protein-protein interactions (59M proteins, 20B interactions). Network analysis, GO/KEGG enrichment, interaction discovery, 5000+ species, for systems biology.

Installation

Pick a client and clone the repository into its skills directory.

Installation

Quick info

Author
davila7
Category
Backend
Views
16
GitHub repo

About this skill

Query STRING API for protein-protein interactions (59M proteins, 20B interactions). Network analysis, GO/KEGG enrichment, interaction discovery, 5000+ species, for systems biology.

How to use

  1. Zainstaluj umiejętność w swoim środowisku Claude, upewniając się, że masz dostęp do pliku scripts/string_api.py zawierającego funkcje pomocnicze do operacji REST API bazy STRING. 2. Rozpocznij analizę od mapowania identyfikatorów — przekonwertuj nazwy genów lub białek na identyfikatory STRING za pomocą funkcji string_map_ids(), podając nazwę białka (np. 'TP53') i kod gatunku (np. 9606 dla człowieka). Możesz mapować pojedyncze białka lub listy wielu białek jednocześnie. 3. Pobierz sieci interakcji dla zmapowanych białek, określając poziom pewności i typ dowodów, które chcesz uwzględnić w wynikach. 4. Wykonaj analizę wzbogacania funkcjonalnego na swoich listach białek, aby znaleźć znaczące moduły funkcjonalne i ścieżki biologiczne. 5. Wizualizuj wynikowe sieci białek z kodowaniem kolorami opartym na dowodach i połączeniach, aby lepiej zrozumieć strukturę sieci. 6. W razie potrzeby skonsultuj plik references/string_reference.md z pełną dokumentacją specyfikacji API, aby dostosować parametry zapytań do swoich potrzeb badawczych.

Related skills

drizzle

by lobehub

Drizzle ORM schema and database guide. Use when working with database schemas (src/database/schemas/*), defining tables, creating migrations, or database model code. Triggers on Drizzle schema definition, database migrations, or ORM usage questions.

Backend
79340

youtube-transcribe-skill

by feiskyer

Extract subtitles/transcripts from a YouTube video URL and save as a local file. Use when you need to extract subtitles from a YouTube video.

Backend
24178

supabase-developer

by daffy0208

Build full-stack applications with Supabase (PostgreSQL, Auth, Storage, Real-time, Edge Functions). Use when implementing authentication, database design with RLS, file storage, real-time features, or serverless functions.

Backend
78170

stripe-integration

by wshobson

Implement Stripe payment processing for robust, PCI-compliant payment flows including checkout, subscriptions, and webhooks. Use when integrating Stripe payments, building subscription systems, or implementing secure checkout flows.

Backend
40147

travel-planner

by ailabs-393

This skill should be used whenever users need help planning trips, creating travel itineraries, managing travel budgets, or seeking destination advice. On first use, collects comprehensive travel preferences including budget level, travel style, interests, and dietary

Backend
4379

fastapi-templates

by wshobson

Create production-ready FastAPI projects with async patterns, dependency injection, and comprehensive error handling. Use when building new FastAPI applications or setting up backend API projects.

Backend
327582