Toolverse
All skills

reactome-database

by davila7

Query Reactome REST API for pathway analysis, enrichment, gene-pathway mapping, disease pathways, molecular interactions, expression analysis, for systems biology studies.

Installation

Pick a client and clone the repository into its skills directory.

Installation

Quick info

Author
davila7
Category
Frontend

About this skill

Query Reactome REST API for pathway analysis, enrichment, gene-pathway mapping, disease pathways, molecular interactions, expression analysis, for systems biology studies.

How to use

  1. Zainstaluj skill w swoim środowisku Claude/Copilot, wskazując repozytorium davila7/claude-code-templates i ścieżkę cli-tool/components/skills/scientific/reactome-database.

  2. Przygotuj listę genów lub białek, które chcesz przeanalizować. Możesz pracować z danymi ekspresji genów lub prostą listą identyfikatorów.

  3. Użyj Content Service (https://reactome.org/ContentService) do pobrania informacji o szlakach biologicznych — możesz wyszukiwać konkretne szlaki, reaktancje, kompleksy lub cząsteczki uczestniczące w procesach biologicznych.

  4. Dla analizy statystycznej zastosuj Analysis Service — wybierz typ analizy (overrepresentation analysis dla list genów lub expression data analysis dla danych ekspresji) i prześlij swoje dane.

  5. Przeanalizuj wyniki, aby zidentyfikować statystycznie istotne szlaki biologiczne powiązane z Twoimi danymi. Wyniki możesz wizualizować w Reactome Pathway Browser.

  6. Jeśli pracujesz z wieloma organizmami, wykorzystaj funkcję porównania szlaków między gatunkami, aby zrozumieć ewolucyjne różnice w procesach biologicznych.

Related skills

interactive-dashboard-builder

by anthropics

Build self-contained interactive HTML dashboards with Chart.js, dropdown filters, and professional styling. Use when creating dashboards, building interactive reports, or generating shareable HTML files with charts and filters that work without a server.

Frontend
2298

livewire-development

by spatie

Develops reactive Livewire 4 components. Activates when creating, updating, or modifying Livewire components; working with wire:model, wire:click, wire:loading, or any wire: directives; adding real-time updates, loading states, or reactivity; debugging component behavior;

Frontend
2335

screenshot-to-code

by OneWave-AI

Convert UI screenshots into working HTML/CSS/React/Vue code. Detects design patterns, components, and generates responsive layouts. Use this when users provide screenshots of websites, apps, or UI designs and want code implementation.

Frontend
94209

markitdown

by K-Dense-AI

Convert various file formats (PDF, Office documents, images, audio, web content, structured data) to Markdown optimized for LLM processing. Use when converting documents to markdown, extracting text from PDFs/Office files, transcribing audio, performing OCR on images, extracting

Frontend
75173

apple-reminders

by openclaw

Manage Apple Reminders via the `remindctl` CLI on macOS (list, add, edit, complete, delete). Supports lists, date filters, and JSON/plain output.

Frontend
2085

browser-use

by browser-use

Automates browser interactions for web testing, form filling, screenshots, and data extraction. Use when the user needs to navigate websites, interact with web pages, fill forms, take screenshots, or extract information from web pages.

Frontend
23107