pymatgen

Materials science toolkit. Crystal structures (CIF, POSCAR), phase diagrams, band structure, DOS, Materials Project integration, format conversion, for computational materials science.

1. Zainstaluj pymatgen za pomocą pip: uruchom uv pip install pymatgen w terminalu. Jeśli planujesz dostęp do bazy Materials Project, dodaj uv pip install pymatgen mp-api. Dla dodatkowych narzędzi analitycznych lub wizualizacji zainstaluj uv pip install pymatgen[analysis] lub uv pip install pymatgen[vis].

2. Wczytaj strukturę krystaliczną z pliku — pymatgen automatycznie rozpoznaje format (POSCAR, CIF, XYZ i inne). W skrypcie Pythona zaimportuj Structure z pymatgen.core i użyj Structure.from_file("nazwa_pliku") aby załadować strukturę.

3. Analizuj właściwości struktury: sprawdzaj grupy przestrzenne, symetrię, otoczenia koordynacyjne oraz obliczaj odległości między atomami. Biblioteka udostępnia metody do automatycznego rozpoznania tych cech.

4. Oblicz diagramy fazowe i termodynamiczne właściwości materiału, aby ocenić stabilność struktury w różnych warunkach.

5. Analizuj strukturę elektronową — wczytaj dane pasma energetycznego i gęstości stanów z wyników obliczeń VASP lub innych kodów, aby określić przerwy energetyczne i właściwości elektroniczne.

6. Generuj powierzchnie, warstwy (slaby) i interfejsy dla badań katalitycznych lub właściwości powierzchniowych. Pymatgen automatyzuje tworzenie tych struktur na podstawie struktury objętościowej.