metabolomics-workbench-database

Access NIH Metabolomics Workbench via REST API (4,200+ studies). Query metabolites, RefMet nomenclature, MS/NMR data, m/z searches, study metadata, for metabolomics and biomarker discovery.

1. Zainstaluj umiejętność w swoim środowisku Claude/Copilot, dodając plik skill do katalogu umiejętności agenta. 2. Zainicjuj połączenie z REST API Metabolomics Workbench – nie wymaga klucza API, wszystkie zapytania kierowane są bezpośrednio do publicznego endpointa metabolomicsworkbench.org. 3. Aby wyszukać metabolit, użyj identyfikatora z obsługiwanych baz danych (PubChem CID, InChI Key, KEGG ID, HMDB ID) – na przykład zapytaj o strukturę lub właściwości konkretnego związku chemicznego. 4. Pobieraj dane studium, metadane eksperymentalne i wyniki – umiejętność zwraca informacje o warunkach badania, próbkach i wynikach analizy spektrometrycznej. 5. Wykonuj wyszukiwania masowe po wartościach m/z (stosunek masy do ładunku) dla identyfikacji nieznanych metabolitów na podstawie danych spektrometrycznych. 6. Krzyżuj wyniki między bazami danych – umiejętność automatycznie mapuje identyfikatory metabolitów między PubChem, KEGG, HMDB i innymi standardowymi bazami dla kompleksowej analizy.