K
kegg-database
Direct REST API access to KEGG (academic use only). Pathway analysis, gene-pathway mapping, metabolic pathways, drug interactions, ID conversion. For Python workflows with multiple databases, prefer bioservices. Use this for direct HTTP/REST work or KEGG-specific control.
Installation
Pick a client and clone the repository into its skills directory.
Installation
About this skill
Direct REST API access to KEGG (academic use only). Pathway analysis, gene-pathway mapping, metabolic pathways, drug interactions, ID conversion. For Python workflows with multiple databases, prefer bioservices. Use this for direct HTTP/REST work or KEGG-specific control.
How to use
- Zainstaluj umiejętność w swoim środowisku Claude, upewniając się, że masz dostęp do biblioteki
scripts/kegg_api.pyzawierającej funkcje pomocnicze. 2. Zaimportuj potrzebną funkcję z modułu — na przykładfrom scripts.kegg_api import kegg_infodo pobrania metadanych bazy lubfrom scripts.kegg_api import kegg_listdo wyliczenia wpisów. 3. Określ, jakie dane potrzebujesz: informacje o bazie danych (struktura, wersja), listę szlaków dla organizmu, geny, związki chemiczne czy enzymy. 4. Wywołaj odpowiednią funkcję z parametrem bazy — przykładowokegg_info('pathway')dla informacji o szlakach lubkegg_list('hsa')dla ludzkiego genomu. 5. Przetwórz zwrócone dane JSON w swoim skrypcie — wyniki zawierają identyfikatory wpisów, nazwy i metadane potrzebne do dalszej analizy. 6. Pamiętaj, że API KEGG dostępne jest wyłącznie do użytku akademickiego — upewnij się, że Twoje zastosowanie spełnia wymogi licencji akademickiej.