B
brenda-database
Access BRENDA enzyme database via SOAP API. Retrieve kinetic parameters (Km, kcat), reaction equations, organism data, and substrate-specific enzyme information for biochemical research and metabolic pathway analysis.
Installation
Pick a client and clone the repository into its skills directory.
Installation
About this skill
Access BRENDA enzyme database via SOAP API. Retrieve kinetic parameters (Km, kcat), reaction equations, organism data, and substrate-specific enzyme information for biochemical research and metabolic pathway analysis.
How to use
- Zainstaluj skill brenda-database w swoim środowisku Claude lub Codex, wskazując repozytorium davila7/claude-code-templates. 2. Zaimportuj moduł brenda_client, który zawiera funkcje do komunikacji z API SOAP bazy BRENDA. 3. Aby pobrać parametry Km dla enzymu, użyj funkcji get_km_values() z numerem EC enzymu – na przykład get_km_values("1.1.1.1") dla dehydrogenazy alkoholowej. 4. Opcjonalnie zawęź wyniki, dodając parametr organism (np. "Saccharomyces cerevisiae") lub substrate (np. "ethanol"), aby uzyskać dane dla konkretnego organizmu lub substratu. 5. Przeanalizuj wyniki – każdy wpis zawiera wartość Km, organizm, substrat i komentarze z literatury naukowej. 6. Powtórz zapytania dla różnych enzymów lub warunków, aby porównać parametry kinetyczne, zidentyfikować enzymy do konkretnych reakcji lub wspomóc projektowanie szlaków metabolicznych.