Toolverse
All skills

benchling-integration

by davila7

Benchling Ru0026D platform integration. Access registry (DNA, proteins), inventory, ELN entries, workflows via API, build Benchling Apps, query Data Warehouse, for lab data management automation.

Installation

Pick a client and clone the repository into its skills directory.

Installation

Quick info

Author
davila7
Category
DevOps

About this skill

Benchling Ru0026D platform integration. Access registry (DNA, proteins), inventory, ELN entries, workflows via API, build Benchling Apps, query Data Warehouse, for lab data management automation.

How to use

  1. Zainstaluj Python SDK Benchling za pomocą polecenia uv pip install benchling-sdk lub poetry add benchling-sdk. Upewnij się, że masz dostęp do instancji Benchling i wygenerowany klucz API z ustawień profilu.

  2. Skonfiguruj autentykację w swoim skrypcie Python. Dla skryptów użyj ApiKeyAuth z kluczem API, a dla aplikacji użyj ClientCredentialsOAuth2 z identyfikatorem klienta i tajnym hasłem. Zawsze przechowuj poświadczenia w zmiennych środowiskowych, nigdy nie umieszczaj ich bezpośrednio w kodzie.

  3. Zainicjuj obiekt Benchling, podając adres URL swojej instancji (np. https://twoja-domena.benchling.com) oraz wybraną metodę autentykacji.

  4. Używaj SDK do zarządzania encjami rejestru (sekwencje DNA, proteiny), operacji inwentarzowych (próbki, kontenery, transfery) lub tworzenia wpisów w elektronicznym notatniku laboratoryjnym.

  5. Dla zaawansowanych scenariuszy skonfiguruj integracje oparte na zdarzeniach z AWS EventBridge lub wysyłaj zapytania do Benchling Data Warehouse w celu analizy danych historycznych.

  6. Testuj integrację na środowisku testowym przed wdrożeniem w produkcji, aby upewnić się, że przepływy pracy działają prawidłowo z Twoimi danymi laboratoryjnymi.

Related skills

senior-data-engineer

by davila7

World-class data engineering skill for building scalable data pipelines, ETL/ELT systems, and data infrastructure. Expertise in Python, SQL, Spark, Airflow, dbt, Kafka, and modern data stack. Includes data modeling, pipeline orchestration, data quality, and DataOps. Use when

DevOps
1268

grafana-dashboards

by wshobson

Create and manage production Grafana dashboards for real-time visualization of system and application metrics. Use when building monitoring dashboards, visualizing metrics, or creating operational observability interfaces.

DevOps
92262

aws-solution-architect

by alirezarezvani

Design AWS architectures for startups using serverless patterns and IaC templates. Use when asked to design serverless architecture, create CloudFormation templates, optimize AWS costs, set up CI/CD pipelines, or migrate to AWS. Covers Lambda, API Gateway, DynamoDB, ECS, Aurora,

DevOps
1231

cloudflare-manager

by qdhenry

Comprehensive Cloudflare account management for deploying Workers, KV Storage, R2, Pages, DNS, and Routes. Use when deploying cloudflare services, managing worker containers, configuring KV/R2 storage, or setting up DNS/routing. Requires CLOUDFLARE_API_KEY in .env and Bun

DevOps
20122

crawl4ai

by basher83

This skill should be used when users need to scrape websites, extract structured data, handle JavaScript-heavy pages, crawl multiple URLs, or build automated web data pipelines. Includes optimized extraction patterns with schema generation for efficient, LLM-free extraction.

DevOps
11128

azure-devops-rest-api

by Tiberriver256

Guide for working with Azure DevOps REST APIs and OpenAPI specifications. Use this skill when implementing new Azure DevOps API integrations, exploring API capabilities, understanding request/response formats, or referencing the official OpenAPI specifications from the

DevOps
995